正如人的心脏一样，色谱柱的，泵头外的压力显然高于泵头内，在这两种压差下出口单向阀的宝石球落回到阀座上;而对于入口单向阀，因为外界大气压大于泵腔内的压力，宝石球离开阀座，流动相顺利的进入泵腔。
与此相反的输液过程，由于柱塞杆的运动使压力增加，入口单向阀的宝石球落回到阀座，入口单向阀处于关闭状态;当泵头内的压力继续增加，并且超过了泵头外的色谱柱的反压时，出口单向阀开启，流动相输出。