组织建立HACCP食品安全与卫生管理体系，并最终由第三方进行认证具有十分重要的意义，具体表现在以下几个方面：
1改善内部过程，强化组织自身的食品安全与卫生管理，提高管理水平；
2强调加工控制；
3通过定期审核来维持体系运行，防止系统崩溃；
4HACCP验证、补充和完善了传统的检验方法；
5安全检验集中在预防性上；
6集中在影响产品安全的关键加工点上；
7通过对相关法规的实施，提高声誉，避免认证企业违反相关法规；
8认证能作为公司的敬业依据，降低负债倾向；当市场把认证作为的准入要求时，增加出口和进入市场的机会；
9提高消费者的信心；
10减少顾客审核的频度；
11强调执法人员和企业之间的交流；
12与非认证的企业相比，有更大的竞争优势；
13不需要大的投资,可使其既简单又有效；
14制定和实施HACCP计划可随时与国际有关食品法规接轨，推动我国食品安全与卫生法律、法规的贯彻落实；
15改善公司形象；
16促进国际贸易，清除非关税壁垒；
17有利于提高员工的食品安全与卫生意识；