水在色谱柱中没有保留，按设定的流速通过色谱柱及抑制器，最先在电导池被检测到信号，因其电导低于淋洗液的背景电导，因此以负峰出现。虽OH体系的淋洗液抑制后理论上应该是水，可是因为药品及环境等原因不可能是纯水，就是说会有一定的背景电导，所以水进入电导池后也会出现一个小负峰。
水负峰形成前电导池中是淋洗液的抑制产物（H2CO3或H2O），水峰出现时电导池内是没有保留的样品中的水