偏光显微镜是精密而贵重的仪器，又是教学和科研工作中必不可少的常用仪器工具，如有损坏，将会直接影响到教学和科研工作，继而使国家和集体的财产遭到损失。因此，应经常对偏光显微镜进行保养和维护，使用过程中应自觉的遵守一下的操作规程。
(1)使用前应事先进行仔细的检查。
(2)偏光显微镜要对座固定位置使用，最好不要去随意改动和搬走显微镜设备，如确实需要改动或搬动显微镜时，动作一定要轻，严防震动，以免损坏光学系统。在移动显微镜的过程中，应以右手握镜臂，左手托住偏光显微镜底座。
(3)显微镜所有镜头一般均经过校验，不得随意自行拆开;镜头必须随时保持清洁，如有尘土，需用笔刷或者镜头纸轻轻将灰尘清除，切勿用手或者其他物品擦拭，以防止损坏显微镜的镜头。
(4)显微镜镜头及其他附件，均需放置于原附件盒中，并将各自在指定位置放好，严防坠地，附件盒用完后放回原处。
(5)切勿随便自行拆卸显微镜，或将附件任意调换使用。
(6)薄片置于载物台上时，其盖玻片必须向上，而且用弹簧夹夹紧。
(7)用高倍物镜调焦时，需用眼睛在旁一边留意观察，切忌薄片被压碎或者损坏镜头。
(8)更换物镜时，一定要用手握住转盘转动，切忌用手直接握住物镜转动，以免物镜发生松动。
(9)使用上偏光镜及勃氏镜，在推送时切忌用力过猛，以免震坏。
(10)仪器损坏或者调节失灵时，应及时与管理人员联系，切勿强力扭动或者擅自处理。
(11)偏光显微镜操作使用完毕，需将上偏光镜及勃氏镜推入，转动粗动手轮将物镜提起，镜筒上留一个目镜，关闭电源并罩上仪器罩。