无水纯DMSO本身就是溶菌剂，DMSO溶解细菌和溶解尼龙是一个道理，必有一端能用，无水的，能溶尼龙的就无菌，有水的，除菌的过膜没问题。
只能用尼龙滤膜或改性纤维素膜的滤器，康宁公司和密理博公司都有相应的型号，价格是14-16元/个。可以一次过滤50ml，储存在无菌容器中备用，
取用DMSO时，不可使用一次性注射器，因为其中的活塞是橡胶制成，可被DMSO溶胀。一定要使用玻璃注射器，或者使用移液器吸取。
Pall公司和其他公司的细胞培养专用DMSO，是经过除菌的，可以直接使用。
一般细胞培养的用液均需要无菌处理，DMSO或者无水乙醇或水溶解后加入培养的细胞用液更需要如此，不过DMSO是有机溶剂用一般的针头滤器就会将滤膜融解，如：要过滤DMSO溶解的DTZ，需要使用耐DMSO的Nylon材料滤膜(摘自生物谷)但如果是只作简单的验证或测量鉴定，也可以考虑不过滤而直接使用，因为不会大批量的细胞污染，相关资料也可以从生物谷中查找