卫生泵海水有时在船上作为浴室的冲洗水。卫生泵从海水箱中吸入海水，并将它输送到船上的冲洗阀门。一般采用两台电动机驱动的单级离心泵。当每台泵都满足全船的最大供水要求时，排出管线上压力开关能自动关闭其中一台泵，从而使它作为备用泵。为了减少卫生泵开关的次数，卫生系统中也常与前面所描述的于生活用水系统中水门相似的空压箱。卫生泵安装在船的底部，以便进行溢流灌溉。